口袋妖怪火红的神兽分布位置及捕捉方法是玩家通关过程中的重要目标。火焰鸟作为火属性神兽固定刷新在火焰山山顶，玩家需携带水属性宝可梦进行属性克制。急冻鸟位于双子岛深处，需将岩石推入洞中挡住急流才能进入瀑布后的山洞。闪电鸟则栖息在无人发电厂，电系属性使其对地面系技能免疫。这三只传说鸟类神兽等级均为50级，建议准备充足的高级球和状态异常技能以提高捕获概率。
雷公、炎帝和水君三大神兽需要完成主线剧情后才能遭遇。雷公出现在岩山顶端，炎帝藏身于熔岩洞深处，水君则在瀑布底部活动。洛奇亚作为70级水系传说宝可梦，需前往第八座彩虹岛右下方海域寻找。超梦作为游戏中最强神兽，位于华蓝洞窟最底层，挑战前需确保队伍中有能对抗超能力属性的宝可梦。冰神柱同样在双子岛区域，需在滑冰场完成特定移动路径才会现身。
幽灵塔顶层的吉拉奇和第九座彩虹岛的迪奥西斯属于特殊遭遇型神兽。吉拉奇需要通过幽灵塔层层关卡并躲避机关陷阱，迪奥西斯则需完成拼图游戏才会出现。古拉顿可在1号岛火焰山地下洞穴找到，其地面系属性对电系技能有完全抗性。部分神兽如雷公在击败四大天王后会在关东地区草丛随机出现，建议使用喷雾剂控制野生遭遇频率。
捕捉神兽前需做好充分准备，包括提升宝可梦等级、携带足够的高级球和大师球。状态异常技能如催眠术和电磁波能显著提高捕获率，刀背打击等保留对手1HP的技能也很有价值。不同神兽有各自的属性弱点，组建针对性队伍是成功捕获的关键。游戏后期可通过船票前往各岛屿探索更多神兽栖息地，完成全图鉴收集需要系统性的规划和多次尝试。
神兽的出现往往与游戏进度和特殊条件相关，建议在挑战四大天王前完成主要神兽的捕捉。部分神兽如急冻鸟和闪电鸟所在区域需要冲浪、怪力等秘传技能才能到达。记录神兽出现位置并制定合理路线能提升探索效率，使用快速移动功能可节省往返时间。
